すぐできる 分子シミュレーション ビギナーズマニュアル

著者 | 長岡正隆・編著 |
出版社 | 講談社サイエンティフィク |
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サイズ | A5判・291ページ |
DVD-ROM付属 ![]() | |
ISBN | 978-4-06-154356-0 |
価格(税込) | 4,725円 |
(2008/11/28) | |
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本書の特徴
やりたい計算がすぐできる! 本書では分子動力学ソフトAMBER9(およびAMBER7)を中心に、実際の計算手順やテクニックを紹介しています。AMBER日本語解説書としても重宝することでしょう。 分子シミュレーションを始めるの学生や研究者にお薦めの入門書です。
付属DVD-ROMには、多数のサンプルファイルが収録されています。このDVD-ROMには、WinSANDER71)も収録されているので、まだAMBERを手に入れていない方々にも、分子シミュレーションを体験することができるようになっています。
1) WinSANDER7は、開発者の許可を得てAMBER7のSANDERをWindows用にコンバートしたものです。体験版のため、利用可能な系が制限されています。
目次
- A章 分子シミュレーションの基礎知識
- B章 計算機環境のセットアップ
- C章 計算を始めてみよう
- D章 孤立分子系や気相分子系を取り扱ってみよう
- E章 分子凝縮系を取り扱ってみよう
- F章 生体分子を取り扱ってみよう
- [ 目次詳細 ]
演習課題の解答
DVDに収録されている演習課題は解き終わりましたか?
C6の解答例・ C9の解答例・ D1の解答例・ D3の解答例・ D5の解答例・ E1の解答例・ E8の解答例・ F2の解答例
本書に収録できなかった情報(随時更新)
無料で解析する
本書には分子動力学シミュレーションの計算結果を解析するツールが付属しておりません。しかし、最近公開されたAmberToolsを利用すれば、無料で解析することが可能になります。
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