長岡研究室(名古屋大学大学院情報科学研究科物質情報講座)

研究室セミナー

2007年度
高柳 昌芳
「Parallel replica method for dynamics of infrequent events」
小谷野 哲之
「Comparison of Charge Models for Fixed-Charge Force Fields: Small-Molecule Hydration Free Energies in Explicit Solvent」
優 乙石
「Hsp70 chaperones accelerate protein translocation and the unfolding of stable protein aggregates by entropic pulling」
岡本 拓也
「主成分分析と独立成分分析を用いたペプチドのコンフォメーションとフォールディング経路の解明」
岩橋 知令
「Internal cavities and ligand passageways in human hemoglobin characterized by molecular dynamics simulations」
中川 幸紀
「Quantaum Mechanical Simulations of Water and Ammonia Molecules and Their Clusters」
太田 雄介
「Analytical RISM-MP2 free energy gradient method:Application to the Schlenk equilibrium of Grignard reagent」
高柳 昌芳
「Conformational Dynamics in a Dipeptide After Single-Mode Vibrational Excitation」
小谷野 哲之
「Structural Optimization of Ammonia Ionization Process in Aqueous Solution via Free Energy Gradient Method」
竹中 規雄
「Modeling real dynamics in the coarse-grained representation of condensed phase systems」
優 乙石
「A coupled RISM/MD or MC simulation methodology for solvation free energies」
岡本 拓也
「メゾスコピック溶媒中のブラウン粒子に関する摩擦と拡散について」
岩橋 知令
「A 45-ns Molecular Dynamics Simulation of Hemoglobin in Water by Vectorizing and Parallelizing COSMOS90 on the Earth Simulator: Dynamics of Tertiary and Quaternary Structures」
中川 幸紀
「Ab Initio Molecular Dynamics Simulation of the Solvation and Transport of H3O+ and OH- Ions in Water」
竹中 規雄
「Enthalpy-Entropy and Cavity Decomposition of Alkane Hydration Free energy: Numerical Results and Implications for Theories of Hydrophobic Solvation」
太田 雄介
「Metastable Sorption State of a Metal-Organic Porous Material Determined by In Situ Synchrotron Powder Diffraction」
高柳 昌芳
「Molecular Dynamics Study on the Solvent Dependent Heme Cooling Follwoing Ligand Photolysis in Carbonmonoxy Myoglobin」
小谷野 哲之
「Theoretical pKa estimates for solvated P(OH)5 from coordination constrained Car-Parrinello molecular dynamics」
優 乙石
「Transitional-Entropy Gain of Solvent upon Protein Folding」

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