************第49回尾張コンプレックスセミナー************* 題 目: MS-EVB法による反応分子動力学シミュレーションの高速化 Title :  Accelerating the reactive molecular dynamics simulation based on the MS-EVB method 発 表 者: 山下 雄史 Speaker :  Takefumi Yamashita 所  属: 東京大学 Affiliation:University of Tokyo 日 時: 9月24日(月)午後1時30分〜 Date : Tues. Sep. 26th, 1:30 pm (Almost one hour) 場 所: 情報科学研究科4階演習室 (4Fエレベータを降りてすぐ右の部屋) Place : Seminar Room (4F), Graduate School of Information Science 内  容: 生体系でおこる化学反応を原子レベルで追うことは、生命科学の重要 なテーマになっている。理論的な観点からは、分子動力学(MD)法が 有力な手法であるが、現在標準的に用いられている経験的力場は化学 結合の切り替えが記述できない。これを補う方法として、量子化学計 算を使う方法が考えられるが、非常に計算コストが高く統計計算を行 うのは困難である。一方、我々の使っているMS-EVB法の計算コストは 比較的軽く、これまで様々な化学反応系、特にプロト>ン移動を含む 系に適用してきた。本発表では、このMS-EVB法をさらに加速する新し い近似法をいくつか紹介する。今回開発した近似方法論を使えば、大 きく計算精度を落とすことなく通常の古典MD計算と同程度の計算コス トで化学反応動力学計算が可能になる。 ***********************************************************